Бальнеологический профиль донных отложений
Донные отложения представлены сапропелями. Площадь сапропелевой залежи составляет 74га, что равно 49% от площади водного зеркала.
Строение грязевой залежи линзообразное и характеризуется постепенным нарастанием мощности к центру озера.
Сапропелевая залежь озера состоит из трех горизонтов пресноводного бессульфидного среднезольного сапропеля, подразделяющихся по видовому составу на органический, органо - железистый и органо – известковистый и относятся к единому бальнеологическому типу лечебных грязей.
Лечебные грязи озера Большой Тараскуль являются пресноводными, низкоминера-лизованными, средне- и высокозольными, бессульфидными грязями Молтаевской разновидности.